國土資源是國之根本，舉凡國土的規劃、地政、林務、礦務、水資源、觀光旅遊、保育、水土保育與防災減災等等問題，都與國土資源的特色與經理有關。過去政府各部門各司其職，還能完成各項任務，然而隨著新的課題不斷凸顯過去單獨部門常無法單獨勝任各種挑戰。因此部門之間的整合，必須有一機制能面對這些窘境。新的組織應該能符合新的任務需求與挑戰。而類似日本國土地理院，做為國家資源的整合、分析的機構，以因應各種的災害防治、資源調查、資料管理的問題，也應該是我國面對國土資源經營管理時要面對的。
過去我國政府各部門，有各式各樣的國土資源資料，只是以不同的格式保存著。有些單位有許多寶貴的資料，但是對資料的保存，並不特別重視。有些單位也重複耗了許多經費做了許多類似的研究，蒐集類似的資料。其中有一個環節是記錄國土相關資源的檔案，常無法有系統、效率的紀錄或保存，常常造成毀損或遺失，真是非常可惜。
因此，一個能整合各種國土資訊，蒐集並分析資料，以便提供或支援各單位所需的機構，應該是有效能的政府必須具備的。這樣的單位平日負責蒐集、分類、整理、儲存、保管不同形式的資料，乃至具有調查與規劃的能力，提供給政府及社會各界所需要的資料。例如各種航空照片、衛星影像資料、各種不同的測量、地質資料、不同年代的地圖、各種環境監測資訊的整理與各種調查成果等等。上述的資料，目前分散存放於各單位，資料格式常以最原始的形式存放，並沒有整理與分析。因此能否發揮資料收集與分析的功能，和資料是否會因天災毀損的處理，都需要一個整合機構處理。
雖然經建會可以整合各單位，但是其任務的並非去蒐集、整理資料。另外，以中央氣象局而言，該局是一個整理資料非常具有效率的單位，近幾年來服務各界也是有目共睹，但是服務的項目主要是以氣象、海象、氣象衛星與地震資料為主。農委會林務局的航空測量所，在航空攝影與製圖上，也扮演了非常好的角色，但是主要業務仍限於航空攝影與製圖。任務編組中有關災害防救的國土災害監測中心或國土規劃相關單位，也仍有待成立或更進一步擴充格局。因此要能整合上述國土資源，勢必有賴一個研究機構，結合所謂的產官學研的整合機構，並經過長期的努力。
一個勇於認識、具有長遠眼光的政府，應該要能積極利用國土資源研究中心，整合各單位的國土資源相關資料,讓整個社會更有挑戰性。面對著二十一世紀的內外的挑戰，有其必要性，更有其急迫性。