慈湖位於金門西北側，金寧鎮的西側沿海地帶。早年此湖為一潟湖，故其內部風平浪靜，為當地居民進行海上活動、貿易的主要場域。然而自1949年後，由於國防保安因素之影響，因此國軍於潟湖西側出海口築堤阻斷潟湖與海洋間的聯繫。自此之後，慈湖遂成為一半鹹水湖直至今日。由於軍事管制與慈湖受到阻斷等因素的影響，目前慈湖內並無人為活動的影響，因此成為金門國家公園範圍內重要生物資源-鸕鶿的主要棲息地。鸕鶿每年於冬季進入慈湖避冬，因此冬季時慈湖伴隨著夕陽與鸕鶿的身影，成為當地相當著名的特殊景觀。